Başantrenörlük kariyerine 2000-2002 sezonunda Olympiakos’ta başlayan Yunan koç, ardından Sagesse, Peristeri, Aris, Paris-Levallois, Zalgiris Kaunas, Yunanistan Milli Takımı, Anadolu Efes ve son olarak Zalgiris Kaunas’ta görev yapmıştı. Olympiakos ile 2001 yılında ULEB Euroleague’de çeyrek final ve Yunanistan Ligi’nde final oynama başarısı göstermiş olan 48 yaşındaki antrenör, 2004’te Sagesse Beirut ile FIBA Asya şampiyonluğuna ve Lübnan şampiyonluğuna ulaştı. 2009-2010 sezonunda Panellinios’u Eurocup’ta Final Four’a çıkaran Yunan teknik adam Eurocup’ta “Yılın coachu” seçildi. 2010-2011 yılında Zalgiris Kaunas ile Litvanya Ligi’de normal sezonu lider olarak tamamlayan Zouros, play-off’ları da şampiyon olarak tamamladı. Yine aynı sezonda Baltık Ligi’nde de şampiyonluk elde etti.
Zouros 2011 yılının Eylül ayında Litvanya’da düzenlenen 2011 Avrupa Basketbol Şampiyonası’nda Yunanistan ile altıncılığı elde etti. 2011-2012 yılının ikinci yarısında ligimizde Anadolu Efes’in başına geçen Yunan coach Lacivert Beyazlılar ile Beko Basketbol Ligi’nde final oynamıştı. Ilias Zouros son olarak 2013-2014 sezonunda Zalgiris Kaunas’ta başantrenör olarak görev yaptı.